Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf1P39428 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf1P39428 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf1P39428 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf1P39428 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf1P39428 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf1P39428 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Traf1P39428 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf1P39428 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf1P39428 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf1P39428 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf1P39428 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf1P39428 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf1P39428 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf1P39428 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms