Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtlP38585 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtlP38585 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtlP38585 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtlP38585 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtlP38585 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtlP38585 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TtlP38585 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtlP38585 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtlP38585 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtlP38585 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtlP38585 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TtlP38585 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtlP38585 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtlP38585 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtlP38585 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtlP38585 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtlP38585 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtlP38585 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TtlP38585 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtlP38585 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtlP38585 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtlP38585 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtlP38585 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtlP38585 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtlP38585 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtlP38585 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtlP38585 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtlP38585 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtlP38585 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtlP38585 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtlP38585 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtlP38585 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtlP38585 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TtlP38585 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtlP38585 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtlP38585 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtlP38585 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtlP38585 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TtlP38585 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TtlP38585 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TtlP38585 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TtlP38585 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtlP38585 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtlP38585 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtlP38585 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtlP38585 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtlP38585 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtlP38585 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtlP38585 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtlP38585 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TtlP38585 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtlP38585 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtlP38585 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtlP38585 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtlP38585 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TtlP38585 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtlP38585 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtlP38585 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtlP38585 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtlP38585 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtlP38585 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtlP38585 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtlP38585 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtlP38585 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtlP38585 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtlP38585 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtlP38585 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtlP38585 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtlP38585 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtlP38585 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtlP38585 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtlP38585 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtlP38585 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtlP38585 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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