Protein–RNA interactions for Protein: P38532

Hsf1, Heat shock factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf1P38532 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hsf1P38532 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hsf1P38532 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hsf1P38532 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms