Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox5P35710 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox5P35710 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox5P35710 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox5P35710 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox5P35710 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms