Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab17P35292 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab17P35292 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab17P35292 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab17P35292 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab17P35292 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab17P35292 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab17P35292 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab17P35292 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms