Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa5P28312 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa5P28312 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa5P28312 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa5P28312 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms