Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa3P28310 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa3P28310 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defa3P28310 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa3P28310 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa3P28310 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa3P28310 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa3P28310 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms