Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja8P28236 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja8P28236 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja8P28236 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja8P28236 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja8P28236 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja8P28236 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja8P28236 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja8P28236 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja8P28236 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja8P28236 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja8P28236 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja8P28236 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja8P28236 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja8P28236 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja8P28236 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja8P28236 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja8P28236 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gja8P28236 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms