Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gjb3P28231 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gjb3P28231 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb3P28231 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms