Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afxP27661 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afxP27661 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afxP27661 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2afxP27661 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afxP27661 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms