Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra2P26048 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms