Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb7P26011 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb7P26011 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms