Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou2f1P25425 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou2f1P25425 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms