Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxd11P23813 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd11P23813 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms