Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf8P23611 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf8P23611 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf8P23611 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf8P23611 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf8P23611 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf8P23611 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf8P23611 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf8P23611 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf8P23611 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf8P23611 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf8P23611 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf8P23611 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf8P23611 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf8P23611 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf8P23611 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf8P23611 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms