Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk1P22518 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk1P22518 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clk1P22518 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clk1P22518 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clk1P22518 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clk1P22518 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clk1P22518 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clk1P22518 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms