Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ms4a2P20490 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ms4a2P20490 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ms4a2P20490 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms