Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P20040 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P20040 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P20040 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P20040 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P20040 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P20040 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P20040 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P20040 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P20040 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P20040 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P20040 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P20040 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P20040 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P20040 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P20040 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P20040 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P20040 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P20040 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P20040 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P20040 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P20040 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P20040 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P20040 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P20040 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P20040 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P20040 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P20040 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P20040 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P20040 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P20040 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P20040 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P20040 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P20040 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P20040 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P20040 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P20040 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P20040 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P20040 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P20040 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P20040 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P20040 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P20040 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P20040 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P20040 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P20040 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P20040 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P20040 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P20040 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P20040 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P20040 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P20040 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P20040 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P20040 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P20040 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P20040 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P20040 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P20040 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P20040 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P20040 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P20040 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P20040 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P20040 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P20040 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P20040 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P20040 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P20040 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms