Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PdgfaP20033 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PdgfaP20033 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms