Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl13aP19253 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms