Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18530 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18530 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18530 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18530 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18530 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18530 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18530 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18530 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18530 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18530 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18530 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P18530 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18530 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18530 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18530 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18530 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18530 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18530 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18530 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18530 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18530 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18530 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18530 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18530 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18530 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18530 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18530 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18530 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18530 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18530 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18530 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18530 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18530 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18530 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18530 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18530 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18530 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18530 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18530 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18530 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18530 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18530 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18530 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18530 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18530 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18530 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18530 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P18530 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18530 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18530 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P18530 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18530 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18530 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18530 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18530 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18530 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18530 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18530 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18530 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18530 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18530 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18530 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18530 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18530 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18530 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18530 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18530 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18530 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18530 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18530 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18530 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18530 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18530 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18530 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18530 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18530 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18530 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18530 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P18530 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18530 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18530 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P18530 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18530 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18530 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18530 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms