Protein–RNA interactions for Protein: P16951

Atf2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf2P16951 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf2P16951 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf2P16951 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf2P16951 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf2P16951 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf2P16951 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf2P16951 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf2P16951 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf2P16951 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf2P16951 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atf2P16951 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Atf2P16951 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atf2P16951 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf2P16951 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf2P16951 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf2P16951 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf2P16951 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf2P16951 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atf2P16951 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf2P16951 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf2P16951 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf2P16951 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf2P16951 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf2P16951 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf2P16951 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Atf2P16951 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf2P16951 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atf2P16951 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf2P16951 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atf2P16951 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf2P16951 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf2P16951 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf2P16951 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf2P16951 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf2P16951 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf2P16951 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf2P16951 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf2P16951 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf2P16951 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf2P16951 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf2P16951 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atf2P16951 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atf2P16951 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atf2P16951 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf2P16951 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf2P16951 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf2P16951 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atf2P16951 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf2P16951 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf2P16951 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf2P16951 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf2P16951 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atf2P16951 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf2P16951 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atf2P16951 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atf2P16951 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms