Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf271P15620 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf271P15620 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf271P15620 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf271P15620 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf271P15620 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf271P15620 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf271P15620 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf271P15620 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf271P15620 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf271P15620 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf271P15620 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf271P15620 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf271P15620 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf271P15620 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf271P15620 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf271P15620 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf271P15620 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms