Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnni2P13412 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnni2P13412 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnni2P13412 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms