Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vpreb2P13373 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb2P13373 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms