Protein–RNA interactions for Protein: P12849

Prkar1b, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1bP12849 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1bP12849 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkar1bP12849 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms