Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
DmdP11531 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DmdP11531 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DmdP11531 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DmdP11531 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DmdP11531 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DmdP11531 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DmdP11531 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DmdP11531 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DmdP11531 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DmdP11531 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DmdP11531 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DmdP11531 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DmdP11531 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DmdP11531 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DmdP11531 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DmdP11531 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DmdP11531 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DmdP11531 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DmdP11531 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DmdP11531 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DmdP11531 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DmdP11531 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DmdP11531 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DmdP11531 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DmdP11531 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DmdP11531 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DmdP11531 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DmdP11531 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DmdP11531 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DmdP11531 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DmdP11531 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DmdP11531 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DmdP11531 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DmdP11531 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DmdP11531 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DmdP11531 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DmdP11531 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DmdP11531 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DmdP11531 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DmdP11531 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DmdP11531 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DmdP11531 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DmdP11531 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DmdP11531 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DmdP11531 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DmdP11531 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DmdP11531 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DmdP11531 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DmdP11531 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DmdP11531 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DmdP11531 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DmdP11531 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DmdP11531 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DmdP11531 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DmdP11531 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DmdP11531 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DmdP11531 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DmdP11531 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DmdP11531 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DmdP11531 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DmdP11531 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DmdP11531 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DmdP11531 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DmdP11531 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DmdP11531 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DmdP11531 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DmdP11531 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DmdP11531 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DmdP11531 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DmdP11531 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DmdP11531 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DmdP11531 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DmdP11531 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DmdP11531 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DmdP11531 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DmdP11531 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DmdP11531 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DmdP11531 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DmdP11531 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DmdP11531 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DmdP11531 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DmdP11531 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DmdP11531 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DmdP11531 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DmdP11531 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DmdP11531 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DmdP11531 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms