Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sub1P11031 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sub1P11031 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sub1P11031 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sub1P11031 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms