Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxc6P10629 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc6P10629 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc6P10629 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc6P10629 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc6P10629 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc6P10629 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc6P10629 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc6P10629 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc6P10629 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc6P10629 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc6P10629 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc6P10629 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc6P10629 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms