Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl1P10146 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms