Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myod1P10085 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myod1P10085 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Myod1P10085 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms