Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc1bP0C7A0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1bP0C7A0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms