Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Surf1P09925 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Surf1P09925 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Surf1P09925 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Surf1P09925 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf1P09925 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf1P09925 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf1P09925 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Surf1P09925 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Surf1P09925 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Surf1P09925 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms