Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc9P09633 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Hoxc9P09633 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hoxc9P09633 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms