Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd3P09027 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd3P09027 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd3P09027 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms