Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TtrP07309 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtrP07309 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtrP07309 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtrP07309 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtrP07309 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TtrP07309 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtrP07309 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtrP07309 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtrP07309 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtrP07309 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TtrP07309 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtrP07309 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtrP07309 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtrP07309 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtrP07309 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TtrP07309 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtrP07309 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtrP07309 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtrP07309 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtrP07309 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TtrP07309 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtrP07309 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtrP07309 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtrP07309 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtrP07309 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TtrP07309 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtrP07309 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtrP07309 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtrP07309 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtrP07309 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TtrP07309 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtrP07309 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtrP07309 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtrP07309 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtrP07309 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtrP07309 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtrP07309 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtrP07309 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtrP07309 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TtrP07309 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtrP07309 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtrP07309 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TtrP07309 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtrP07309 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TtrP07309 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtrP07309 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtrP07309 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtrP07309 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TtrP07309 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtrP07309 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TtrP07309 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TtrP07309 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TtrP07309 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TtrP07309 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TtrP07309 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TtrP07309 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TtrP07309 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TtrP07309 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TtrP07309 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TtrP07309 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TtrP07309 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TtrP07309 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TtrP07309 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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