Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Me1P06801 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Me1P06801 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Me1P06801 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Me1P06801 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Me1P06801 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Me1P06801 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Me1P06801 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Me1P06801 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Me1P06801 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Me1P06801 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Me1P06801 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Me1P06801 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Me1P06801 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Me1P06801 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Me1P06801 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Me1P06801 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Me1P06801 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Me1P06801 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Me1P06801 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Me1P06801 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Me1P06801 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Me1P06801 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Me1P06801 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Me1P06801 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Me1P06801 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Me1P06801 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Me1P06801 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Me1P06801 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Me1P06801 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Me1P06801 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Me1P06801 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Me1P06801 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Me1P06801 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Me1P06801 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Me1P06801 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Me1P06801 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Me1P06801 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Me1P06801 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Me1P06801 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Me1P06801 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Me1P06801 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Me1P06801 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Me1P06801 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Me1P06801 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Me1P06801 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Me1P06801 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Me1P06801 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Me1P06801 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Me1P06801 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Me1P06801 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Me1P06801 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Me1P06801 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Me1P06801 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Me1P06801 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Me1P06801 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Me1P06801 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Me1P06801 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Me1P06801 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Me1P06801 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Me1P06801 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Me1P06801 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Me1P06801 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Me1P06801 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Me1P06801 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Me1P06801 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Me1P06801 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Me1P06801 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Me1P06801 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Me1P06801 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Me1P06801 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Me1P06801 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Me1P06801 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Me1P06801 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Me1P06801 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Me1P06801 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Me1P06801 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Me1P06801 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Me1P06801 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Me1P06801 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Me1P06801 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Me1P06801 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Me1P06801 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Me1P06801 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Me1P06801 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Me1P06801 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Me1P06801 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Me1P06801 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Me1P06801 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Me1P06801 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Me1P06801 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Me1P06801 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Me1P06801 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Me1P06801 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Me1P06801 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Me1P06801 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Me1P06801 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Me1P06801 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Me1P06801 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Me1P06801 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms