Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06334 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06334 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06334 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06334 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06334 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06334 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06334 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06334 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06334 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P06334 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06334 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06334 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06334 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06334 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06334 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06334 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06334 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06334 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P06334 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06334 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P06334 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06334 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06334 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06334 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06334 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06334 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
P06334 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06334 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms