Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-Eb1P04230 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-Eb1P04230 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-Eb1P04230 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms