Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P04212 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04212 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P04212 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04212 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04212 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04212 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04212 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04212 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04212 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04212 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P04212 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04212 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04212 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P04212 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04212 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04212 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04212 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04212 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04212 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P04212 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04212 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04212 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04212 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04212 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04212 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04212 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04212 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04212 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04212 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04212 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04212 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04212 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04212 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04212 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04212 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04212 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04212 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04212 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04212 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04212 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04212 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04212 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04212 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04212 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04212 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04212 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04212 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P04212 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04212 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04212 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04212 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04212 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04212 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04212 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04212 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04212 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04212 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04212 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04212 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P04212 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04212 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms