Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tp53P02340 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53P02340 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53P02340 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53P02340 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tp53P02340 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tp53P02340 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53P02340 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tp53P02340 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tp53P02340 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms