Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Ab1P01921 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-Ab1P01921 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-Ab1P01921 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms