Protein–RNA interactions for Protein: P01812

Ig heavy chain V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01812 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01812 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01812 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01812 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01812 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01812 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01812 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01812 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01812 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01812 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01812 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01812 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01812 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01812 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01812 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01812 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01812 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01812 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01812 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01812 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01812 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01812 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01812 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01812 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01812 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01812 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01812 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01812 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01812 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01812 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01812 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01812 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01812 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01812 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01812 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01812 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01812 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01812 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01812 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01812 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01812 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01812 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01812 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01812 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01812 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01812 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01812 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01812 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01812 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01812 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01812 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01812 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01812 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01812 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01812 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01812 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01812 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01812 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01812 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01812 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01812 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01812 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01812 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01812 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01812 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01812 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01812 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01812 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01812 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01812 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01812 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01812 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01812 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms