Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01741 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01741 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01741 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01741 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01741 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01741 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01741 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01741 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01741 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01741 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01741 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01741 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01741 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01741 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01741 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01741 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01741 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01741 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01741 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01741 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01741 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01741 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01741 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01741 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01741 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01741 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01741 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01741 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01741 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01741 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01741 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01741 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01741 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01741 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01741 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01741 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01741 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01741 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01741 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01741 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01741 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01741 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01741 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01741 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01741 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01741 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01741 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01741 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms