Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01740 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01740 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01740 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01740 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01740 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01740 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
P01740 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01740 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01740 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01740 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01740 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01740 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01740 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01740 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01740 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01740 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01740 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01740 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01740 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01740 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01740 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01740 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01740 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01740 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01740 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01740 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01740 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01740 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01740 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01740 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01740 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01740 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01740 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01740 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01740 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01740 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01740 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01740 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01740 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01740 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01740 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01740 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
P01740 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01740 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01740 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01740 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01740 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01740 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01740 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01740 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01740 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01740 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01740 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01740 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01740 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01740 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01740 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01740 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01740 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01740 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01740 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01740 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01740 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01740 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01740 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01740 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01740 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01740 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01740 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01740 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01740 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01740 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01740 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01740 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01740 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01740 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01740 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01740 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01740 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01740 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01740 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01740 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01740 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01740 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01740 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01740 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01740 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01740 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01740 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01740 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01740 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01740 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
P01740 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
P01740 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01740 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms