Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01729 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01729 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01729 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01729 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01729 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01729 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01729 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01729 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01729 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01729 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01729 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01729 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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P01729 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01729 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01729 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P01729 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01729 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01729 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01729 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01729 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01729 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01729 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01729 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01729 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01729 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01729 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01729 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01729 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01729 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01729 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01729 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01729 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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P01729 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01729 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01729 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01729 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01729 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01729 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01729 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01729 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01729 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01729 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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P01729 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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P01729 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01729 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01729 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01729 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01729 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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P01729 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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