Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01680 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01680 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01680 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01680 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01680 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01680 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01680 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01680 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01680 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01680 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01680 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01680 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01680 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01680 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01680 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01680 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01680 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01680 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01680 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01680 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01680 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01680 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01680 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01680 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01680 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01680 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01680 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01680 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01680 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01680 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01680 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01680 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01680 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01680 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01680 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01680 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01680 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01680 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01680 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01680 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01680 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01680 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01680 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01680 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01680 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01680 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01680 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01680 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01680 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01680 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01680 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01680 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01680 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01680 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01680 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01680 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01680 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01680 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01680 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01680 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01680 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01680 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01680 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms