Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01652 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01652 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01652 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01652 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01652 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01652 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01652 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01652 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01652 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01652 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01652 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01652 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01652 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01652 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
P01652 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01652 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01652 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01652 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01652 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01652 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01652 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01652 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01652 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01652 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01652 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01652 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01652 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P01652 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01652 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01652 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01652 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01652 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01652 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01652 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01652 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P01652 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01652 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01652 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P01652 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01652 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01652 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01652 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01652 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01652 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01652 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01652 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01652 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01652 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01652 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01652 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01652 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01652 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01652 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
P01652 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01652 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01652 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01652 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01652 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01652 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01652 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01652 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01652 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01652 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
P01652 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01652 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01652 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01652 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01652 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
P01652 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01652 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01652 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01652 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01652 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01652 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01652 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01652 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01652 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01652 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01652 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01652 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01652 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01652 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01652 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01652 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01652 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01652 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01652 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01652 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01652 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01652 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01652 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
P01652 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01652 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01652 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01652 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01652 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01652 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P01652 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01652 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms