Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actn3O88990 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn3O88990 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn3O88990 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn3O88990 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn3O88990 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn3O88990 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn3O88990 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Actn3O88990 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn3O88990 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn3O88990 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn3O88990 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actn3O88990 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms