Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema3fO88632 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema3fO88632 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms